일본에서 꾸준하게 사랑 받아 온 텔레비젼 애니메이션 <우주전함 야마토> 영화화한 작품.

2194년, 가미라스의 침공으로 인류의 대부분이 사망해 버린다. 5년 후, 지구가 방사능으로 오염되어가는 중 코다이 스스무(키무라 타쿠야)는 이스칸달 별에 방사능 제거 장치가 있는 사실을 알게되고, 동료들과 함께 우주 전함 야마토를 타고 이스칸달 별로 향한다.